Erreur: plink introuvable sur noeud 130

Added by Andrea Rau 6 months ago

Bonjour,

Pour info, je me suis rendue compte aujourd'hui qu'il semble y avoir un problème pour exécuter plink sur le noeud 130. Petit exemple reproductible: si je lance le fichier test.sh ci-dessous avec qsub test.sh...

#!/bin/sh
#$ -q longq
#$ -l h='node130'
plink --help

... j'ai le message erreur suivant:
/spool/node130/job_scripts/4190614: line 4: plink : commande introuvable

Le problème n'est pas résolu si j'utilise le path complet de plink (/bao/plink/plink-1.09-x86_64/plink), par contre aucun problème si j'évite le noeud 130 dans le script avec #$ -l h='!node130'.

Merci @ThierryTribout et @ChrisHoze pour leur aide de debugging!

Bonne soirée,
Andrea


Replies (1)

RE: Erreur: plink introuvable sur noeud 130 - Added by Marc Laval 2 months ago

Bonjour Andrea,

Sujet pris en compte, merci ! il est traité dans le ticket https://ctig-forge.jouy.inra.fr/issues/37940 de la forge CTIG

Marc

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