Forge DGA

Quantitative trait loci (QTL) with small effects, which are pervasive in quantitative phenotypic variation, are difficult to detect in genome-wide association studies (GWAS). To improve their detection, we propose to use a local score approach that accounts for the surrounding signal due to linkage disequilibrium, by accumulating association signals from contiguous single markers.

We also updated the scripts, so now is possible to compute the distribution of the local score for xi= 3 and 4, under the assumption that the p-values follow a uniform distribution.

Reference:

• A local score approach improves GWAS resolution and detects minor QTL: application to Medicago truncatula quantitative disease resistance to multiple Aphanomyces euteiches isolates https://www.nature.com/articles/s41437-019-0235-x

Les modifications de la configuration nautilus ont été mises en place

Pour tenter de remédier aux problèmes de temps de réponse de dga20, nous allons faire des modifications dans la configuration de nautilus le gestionnaire de fichiers de dga20.
Ces modifications seront mises en place ce jour (04/06/2019) à 12h30.

Les connexions en cours ne seront pas perturbées

L'intervention concernant le déplacement de l'espace /home est terminée.
dga20 et la cluster sont à nouveau disponibles

Si vous rencontrez toujours des difficultés merci de nous prévenir en essayant de préciser quel outil rencontre des problèmes (nautilus (gestionnaire de fichiers, ...))

La mise en place de la nouvelle infrastructure de stockage pose actuellement des problèmes d'accès au répertoire /home (temps de connexion, utilisation du gestionnaire de fichiers (nautilus)).

Après différents essais d'amélioration, non fructueux à ce jour, et compte tenu de la gêne occasionnée, nous souhaitons basculer dès que nous pouvons l'espace /home vers un autre espace de stockage.

Cette intervention devrait prendre entre 02h00 et 03h00 à partir de 16h00 ce jour (15/05/2019)

Durant cette période, dga20 ne sera pas accessible et l'accès au cluster suspendu.

Les travaux encore en cours sur le cluster seront suspendus le temps de l'intervention et devraient redémarrer ensuite sans problème.

Nous espérons un retour à la normale demain mais si vous rencontrez toujours des difficultés merci de nous prévenir en essayant de préciser quel outil rencontre des problèmes (nautilus (gestionnaire de fichiers, ...))

Bonjour,

Le service informatique du centre nous informe qu'une coupure réseau est programmée demain entre 6h et 8h

Voici le message

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Chers collègues,

Notre fournisseur d’accès internet RENATER vient de nous informer d’une opération de mise à jour logiciel sur leurs équipements de Vilvert qu’il prévoit de réaliser le 15/05/2019 entre 06h et 08h.

Cette opération aura forcément un impact dans ce créneau puisse qu’un redémarrage du routeur est à prévoir, ce qui coupera pendant quelques instants l’accès internet.

Mehdi

Bonjour,

Suite à la mise en place du filesystems "/home" dans le nouvel espace de stockage, DGA20 est très lent, voir inaccessible lorsque vous tentez de vous y connecter,
Nous faisons de notre mieux pour améliorer la situation

Mehdi

DGA20 est maintenant disponible.
Nous avons constaté des améliorations des temps de connexion par rapport à l'avant reboot

Mehdi

Bonjour,

Nous avons identifié une des sources du problème, qui devrait permettre aux utilisateurs d'arriver à se connecter sur DGA20.
Cependant le temps pour se connecter restera supérieur à d'habitude.

Pour cela nous avons besoin de rebooter DGA20.
Le reboot aura lieu 11h ce jour

Mehdi

Bonjour,

Suite à la mise en place du filesystems "/home" dans le nouvel espace de stockage, DGA20 est très lent lorsque vous tentez de vous y connecter.
La connexion direct via SSH fonctionne, avec quelques ralentissements.
La connexion via X2GO est très lente, plusieurs minutes d'attente.

Nous faisons le nécessaire pour améliorer rapidement la situation.

Mehdi