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CTIG Environnement: FImpute3 - version de test (suite)

Ajouté par Thierry Coudert il y a environ 5 ans

Le problème de clés d'activation est résolu. FImpute3 est donc maintenant disponible sur l'ensemble des noeuds du cluster

CTIG Environnement: FImpute3 - version de test

Ajouté par Thierry Coudert il y a environ 5 ans

Actuellement, un problème de clés d'activation fait que cette version ne tourne que sur les noeuds suivants
  • node114
  • node116
  • node120
  • node124

Si vous voulez la tester, n'oubliez pas de suffixer le nom de la classe par le node désiré
exemple: workq@node116

CTIG Environnement: FImpute - version 3 en test

Ajouté par Thierry Coudert il y a environ 5 ans

Une version 3.0 d'essai de FImpute (valide jusqu'au 05/05/2019) vient d'être installée sur les noeuds du cluster.

Cette version ne doit pas être lancée sur dga20. Il faut donc utiliser SGE pour lancer cette version par la commande : FImpute3

La documentation a été mise à disposition dans la Forge du département
https://forge-dga.jouy.inra.fr/projects/ctig-env-base/wiki/Loggen#FImpute

CTIG Environnement: Archivage

Ajouté par Thierry Coudert il y a environ 5 ans

La relance du serveur d'archivage va prendre plus de temps que prévu. Le système est en train de "checker" les différents filesystems dont la taille est de plusieurs teras.
Une annonce sera faite lorsque le serveur sera à nouveau disponible

CTIG Environnement: Archivage

Ajouté par Thierry Coudert il y a environ 5 ans

Le serveur d'archivage sera indisponible du vendredi 29 mars 2019 à 15h00 au mardi 02 avril aux alentours de 12h00.
Le CEA, le partenaire INRA pour le Datacenter Ile de France, effectuera la révision technique et les tests réglementaires annuels des installations techniques durant cette période (du 01 avril 2019 à 08h00 au 02/04/2019 12h00).

SICPA Environnement: Lien Ontologies

Ajouté par Sophie Normant il y a environ 5 ans

CTIG Environnement: Mise à jour de l'outil QINFO

Ajouté par Eric Venot il y a environ 5 ans

Il est désormais possible, pour les jobs lancés en qarray, de spécifier dès le lancement de qinfo le numero de la tache dont on veut récupérer les détails. Voir l'option -t dans le mode d'emploi (lancer qinfo sans paramètre) ou sur la page wiki.

[[https://forge-dga.jouy.inra.fr/projects/ctig-env-base/wiki/Logutil#qinfo]]

Amusez vous bien,
Eric

SICPA Environnement: Réunion en visio le 12/02/2019

Ajouté par Sophie Normant il y a environ 5 ans

Ordre du jour :
Présentation du projet
Retour sur les enquêtes réalisées suite aux visites sur les UE
L’ontologie EOL
La réglementation
Définition des besoins des scientifiques
Discussion sur les liens à mettre en place avec :
  • Les bâtiments / les installations
  • Les animaux lot ou individus
  • La métrologie…

Le stockage et l’interrogation des données
Élaboration du plan de projet d’après le modèle du Cati Sicpa
Discussion sur la constitution du comité de pilotage et la désignation d’un chef de projet métier

Modèle plan de projet Cati Sicpa

CTIG Environnement: Mise à jour de l'outil QINFO

Ajouté par Eric Venot il y a plus de 5 ans

L'outil qinfo disponible sur DGA20 a été mis à jour.

Il permet à tout utilisateur d'avoir une synthèse des jobs en cours sur DGA-CLUSTER (option -n) ou d'obtenir un bilan des différents jobs terminés avec la mémoire réellement utilisée (à comparer avec la mémoire demandée à priori par h_vmem) (option -u) ou d'obtenir des informations plus précises sur un job donné (option -j).

qinfo récupère les informations du mois en cours par défaut. I est aussi possible de récupérer des informations des mois précédents en précisant le mois souhaité avec l'option -d MM/AAAA.

Toutes les informations sont disponibles en tapant qinfo dans un terminal sans paramètre ou sur la page WIKI des utilitaires disponibles au CTIG:

[[https://forge-dga.jouy.inra.fr/projects/ctig-env-base/wiki/Logutil#qinfo]]

Amusez vous bien,
Eric

CTIG Environnement: dga20 disponbile

Ajouté par Thierry Coudert il y a plus de 5 ans

dga20 est à nouveau disponible

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Formats disponibles : Atom