Annonces
CTIG Environnement: Archivage
Le serveur d'archivage sera indisponible du vendredi 29 mars 2019 à 15h00 au mardi 02 avril aux alentours de 12h00.
Le CEA, le partenaire INRA pour le Datacenter Ile de France, effectuera la révision technique et les tests réglementaires annuels des installations techniques durant cette période (du 01 avril 2019 à 08h00 au 02/04/2019 12h00).
CTIG Environnement: Mise à jour de l'outil QINFO
Il est désormais possible, pour les jobs lancés en qarray, de spécifier dès le lancement de qinfo le numero de la tache dont on veut récupérer les détails. Voir l'option -t dans le mode d'emploi (lancer qinfo sans paramètre) ou sur la page wiki.
[[https://forge-dga.jouy.inra.fr/projects/ctig-env-base/wiki/Logutil#qinfo]]
Amusez vous bien,
Eric
CTIG Environnement: Mise à jour de l'outil QINFO
L'outil qinfo disponible sur DGA20 a été mis à jour.
Il permet à tout utilisateur d'avoir une synthèse des jobs en cours sur DGA-CLUSTER (option -n) ou d'obtenir un bilan des différents jobs terminés avec la mémoire réellement utilisée (à comparer avec la mémoire demandée à priori par h_vmem) (option -u) ou d'obtenir des informations plus précises sur un job donné (option -j).
qinfo récupère les informations du mois en cours par défaut. I est aussi possible de récupérer des informations des mois précédents en précisant le mois souhaité avec l'option -d MM/AAAA.
Toutes les informations sont disponibles en tapant qinfo dans un terminal sans paramètre ou sur la page WIKI des utilitaires disponibles au CTIG:
[[https://forge-dga.jouy.inra.fr/projects/ctig-env-base/wiki/Logutil#qinfo]]
Amusez vous bien,
Eric
CTIG Environnement: dga20 disponbile
dga20 est à nouveau disponible
CTIG Environnement: dga20 - connexion
dga20 va être redémarré cejour 23/11/2018 à 17h
CTIG Environnement: connexion à dga20
En ce moment, il est très difficile de se connecter à dga20 avec x2go ou NoMachine.
Une nouvelle annonce sera faite lorsque le problème sera réglé
CTIG Environnement: R - version 3.5.0
La version 3.5.0 de R est maintenant disponible sur les serveurs du CTIG (dga20,dga-cluster).
Elle est accessible via la commande : R350
Cette version de R est aussi accessible depuis Rstudio-Desktop via la commande : rstudio350
Lors de l'installation ou l'upgrade de Packages, il n'est pas nécessaire de spécifier une librairie. Par défaut, ces packages seront installés ou upgradés dans /bar/lib_R3.5.0 (accessible en lecture-écriture ) de façon à ne pas invalider les éventuelles anciennes versions de packages utilisées par des versions antérieures de R.
Tous les packages déjà installés sont accessibles (sous réserve de compatibilité de version) par cette nouvelle version de R
Cette version sera mise en production le 17 septembre 2018 si des problèmes ne sont pas remontés
CTIG Environnement: Cluster - modification de la configuration effectuée
La modification de la configuration des files d'attente est terminée.
La documentation a été mise à jour (classes bigmem et unlimitq )
https://forge-dga.jouy.inra.fr/projects/ctig-env-base/wiki/Dga-cluster-utilisateurs
CTIG Environnement: Cluster - Modification de la configuration le 13 juin 2018
Une modification de la configuration de la gestion des files d'attente (queues) du cluster aura lieu le mercredi 13 juin dans la matinée.
Afin de faciliter le passage des travaux nécessitant beaucoup de mémoire, il a été décidé lors d'un Point Système-Utilisateurs, d'augmenter le nombre de classe unlimitq et de diminuer le nombre de classe bigmem car, actuellement, la classe bigmem est principalement utilisée par des utilisateurs devant soumettre de nombreux jobs en parallèle et durant plus de 2 jours.
Voici un tableau récapitulant la situation actuelle et la situation future :
configuration actuelle | configuration future | |||
max jobs | max jobs/utilisateurs | max jobs | max jobs/utilisateurs | |
bigmem | 160 | 120 | 30 | 15 |
unlimitq | 30 | 12 | 160 | 100 |
Les travaux en cours d'exécution ne seront pas concernés par cette modification.
Les travaux en attente d'exécution se verront appliquer les nouvelles règles.
Il est possible de changer la queue d'un travail en attente d'exécution par la commande qalter.
exemple: modifier la queue d'exécution de bigmem à unlimitq
qalter -q unlimitq n°-du-job
Gemma: Gemma version 6.11 Release N
Bonjour,
Les 4 gemma serveurs Porc, Poule, Lapin et Ruminant sont passés en Release N
Problème sur la création de Gel à la main avec Fluo : bug sur la couleur des fluo en numérique résolu (normalement).
A vous de jouer.
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Formats disponibles : Atom