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PopSizeABC: Faster simulations!

Added by Simon Boitard over 6 years ago

Simulated datasets can now be obtained using msprime (Kelleher et al, 2016), which decreases simulation time by a factor from 10 to 100.

The new functions based on msprime are in comp_stat.1.zip, which can just replace comp_stat.zip. Everything works exactly as with comp_stat.zip (see the wiki for a description), except that msprime must first be installed on your computer, as described here:
https://pypi.python.org/pypi/msprime

GEEDOC: Version 5.08

Added by Marie-Christine Batut over 6 years ago

Bonjour,

Quelques améliorations demandées :
- Complément hormonaux : possibilité de faire les MAJ des traitements dans Geedoc et dans CasaME
- Lait - Traite : import à partir d'un fichier : amélioration (temps d'intégration amélioré)
- Pesées : Calcul des gains : amélioration de la procédure de calcul des gains par animal
- Résultats de reproduction : MAJ du numéro de saillie dans l'onglet "Saillie"

Pour installer comme d'habitude.
Pour voir les nouveautés aller sur la forge et sur le wiki ici https://forge-dga.jouy.inra.fr/projects/geedoc/wiki

A vous de jouer
Kinou

GEEDOC: Version 5.07.02

Added by Marie-Christine Batut over 6 years ago

Bonjour,

Je sais cela fait 2 versions en 15 jours.
Pour ceux qui ont quelques problèmes d'affichage des écrans, vous pouvez installer cette nouvelle version.
Et pour Fabien pour créer une liste pour automate avec des animaux réformés code '005' (Abattus avec contrôle de carcasse).
Dans Lister les saillies : possibilité de n'afficher que les Luttes Libre, ou que les Luttes en main ou que les Luttes Contrôlées.
Sinon rien de nouveau dans cette version.

Pour installer, comme d'habitude.

GEEDOC: Version 5.07

Added by Marie-Christine Batut over 6 years ago

Bonjour,

La nouvelle version V5.07 de GeedocVS est disponible.
A installer directement à partir de Geedoc.
Pour cela aller dans le menu ? puis cliquer sur "MAJ version Geedoc", répondre ensuite aux questions ...

Les nouveautés sont sur la forge sur le wiki https://forge-dga.jouy.inra.fr/projects/geedoc/wiki
La documentation est sur le forge.

GEEDOC: Version 5.06

Added by Marie-Christine Batut over 6 years ago

Bonjour,

La nouvelle version V5.06 de GeedocVS est disponible.
A installer directement à partir de Geedoc.
Pour cela aller dans le menu ? puis cliquer sur "MAJ version Geedoc", répondre ensuite aux questions ...

Les nouveautés sont sur la forge sur le wiki https://forge-dga.jouy.inra.fr/projects/geedoc/wiki
La documentation est sur le forge.

A vous de jouer
Kinou

GEEDOC: Version 5.05

Added by Marie-Christine Batut over 6 years ago

Bonjour,

La nouvelle version V5.05 de GeedocVS est disponible.
A installer directement à partir de Geedoc.
Pour cela aller dans le menu ? puis cliquer sur "MAJ version Geedoc", répondre ensuite aux questions ...

Les nouveautés sont sur la forge sur le wiki https://forge-dga.jouy.inra.fr/projects/geedoc/wiki
La documentation est sur le forge.

A vous de jouer
Kinou
PS : je pars en congés demain soir pour 3 semaines.
Si vous n'avez pas besoin de ces nouvelles options, attendre mon retour.

GEEDOC: Version 5.04

Added by Marie-Christine Batut over 6 years ago

Bonjour,

La nouvelle version V5.04 de GeedocVS est disponible.
A installer directement à partir de Geedoc.
Pour cela aller dans le menu ? puis cliquer sur "MAJ version Geedoc", répondre ensuite aux questions ...

Les nouveautés sont sur la forge sur le wiki https://forge-dga.jouy.inra.fr/projects/geedoc/wiki
La documentation est sur le forge.

A vous de jouer
Kinou

GEEDOC: Version 5.03

Added by Marie-Christine Batut over 6 years ago

Bonjour,

La nouvelle version V5.03 de GeedocVS est disponible.
A installer directement à partir de Geedoc.
Pour cela aller dans le menu ? puis cliquer sur "MAJ version Geedoc", répondre ensuite aux questions ...

Les nouveautés sont sur la forge sur le wiki https://forge-dga.jouy.inra.fr/projects/geedoc/wiki
La documentation est sur le forge.

A vous de jouer
Kinou

GEEDOC: Coupure au CTIG le 02/06/2016 de 7H00 à 8H00

Added by Marie-Christine Batut over 6 years ago

Bonjour

Le 02/06/2016, la DSI va effectuer une opération de maintenance sur le matériel qui porte le cœur de réseau informatique du site de Vilvert.

L'intervention nécessite un arrêt du réseau internet/intranet, par conséquent les serveurs du CTIG ne seront plus accessibles. Les jobs qui tournent en batch ne seront pas impactés.

Durée prévue de l'interruption : 1 heure

Début : Jeudi 2/06/16 - 7h00
Fin (estimation) : Jeudi 2/06/16 – 8h00

Utilisateurs ou services concernés par l'opération
L'ensemble des utilisateurs des services du CTIG (web, FTP, FreeNX, X2GO, SSH, DB2, etc...).

PopSizeABC: Quick start example

Added by Simon Boitard almost 7 years ago

11/04/2016:

A quick start example has been added on the wiki, python and R scripts used for this example have been added in the compressed directories comp_stat.zip and estim.zip.

The description of the files available for download has been updated.

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