Forge DGA

Il est désormais possible, pour les jobs lancés en qarray, de spécifier dès le lancement de qinfo le numero de la tache dont on veut récupérer les détails. Voir l'option -t dans le mode d'emploi (lancer qinfo sans paramètre) ou sur la page wiki.

[[https://forge-dga.jouy.inra.fr/projects/ctig-env-base/wiki/Logutil#qinfo]]

Amusez vous bien,
Eric

Ordre du jour :
Présentation du projet
Retour sur les enquêtes réalisées suite aux visites sur les UE
L’ontologie EOL
La réglementation
Définition des besoins des scientifiques
Discussion sur les liens à mettre en place avec :

• Les bâtiments / les installations
• Les animaux lot ou individus
• La métrologie…

Le stockage et l’interrogation des données
Élaboration du plan de projet d’après le modèle du Cati Sicpa
Discussion sur la constitution du comité de pilotage et la désignation d’un chef de projet métier

Modèle plan de projet Cati Sicpa

L'outil qinfo disponible sur DGA20 a été mis à jour.

Il permet à tout utilisateur d'avoir une synthèse des jobs en cours sur DGA-CLUSTER (option -n) ou d'obtenir un bilan des différents jobs terminés avec la mémoire réellement utilisée (à comparer avec la mémoire demandée à priori par h_vmem) (option -u) ou d'obtenir des informations plus précises sur un job donné (option -j).

qinfo récupère les informations du mois en cours par défaut. I est aussi possible de récupérer des informations des mois précédents en précisant le mois souhaité avec l'option -d MM/AAAA.

Toutes les informations sont disponibles en tapant qinfo dans un terminal sans paramètre ou sur la page WIKI des utilitaires disponibles au CTIG:

[[https://forge-dga.jouy.inra.fr/projects/ctig-env-base/wiki/Logutil#qinfo]]

Amusez vous bien,
Eric

dga20 est à nouveau disponible

dga20 va être redémarré cejour 23/11/2018 à 17h

En ce moment, il est très difficile de se connecter à dga20 avec x2go ou NoMachine.
Une nouvelle annonce sera faite lorsque le problème sera réglé

La version 3.5.0 de R est maintenant disponible sur les serveurs du CTIG (dga20,dga-cluster).

Elle est accessible via la commande : R350

Cette version de R est aussi accessible depuis Rstudio-Desktop via la commande : rstudio350

Lors de l'installation ou l'upgrade de Packages, il n'est pas nécessaire de spécifier une librairie. Par défaut, ces packages seront installés ou upgradés dans /bar/lib_R3.5.0 (accessible en lecture-écriture ) de façon à ne pas invalider les éventuelles anciennes versions de packages utilisées par des versions antérieures de R.

Tous les packages déjà installés sont accessibles (sous réserve de compatibilité de version) par cette nouvelle version de R

Cette version sera mise en production le 17 septembre 2018 si des problèmes ne sont pas remontés

La modification de la configuration des files d'attente est terminée.
La documentation a été mise à jour (classes bigmem et unlimitq )
https://forge-dga.jouy.inra.fr/projects/ctig-env-base/wiki/Dga-cluster-utilisateurs

Une modification de la configuration de la gestion des files d'attente (queues) du cluster aura lieu le mercredi 13 juin dans la matinée.

Afin de faciliter le passage des travaux nécessitant beaucoup de mémoire, il a été décidé lors d'un Point Système-Utilisateurs, d'augmenter le nombre de classe unlimitq et de diminuer le nombre de classe bigmem car, actuellement, la classe bigmem est principalement utilisée par des utilisateurs devant soumettre de nombreux jobs en parallèle et durant plus de 2 jours.

Voici un tableau récapitulant la situation actuelle et la situation future :

	configuration actuelle		configuration future
	max jobs	max jobs/utilisateurs	max jobs	max jobs/utilisateurs
bigmem	160	120	30	15
unlimitq	30	12	160	100

Les travaux en cours d'exécution ne seront pas concernés par cette modification.

Les travaux en attente d'exécution se verront appliquer les nouvelles règles.

Il est possible de changer la queue d'un travail en attente d'exécution par la commande qalter.

exemple: modifier la queue d'exécution de bigmem à unlimitq

qalter -q unlimitq n°-du-job

Bonjour,

Les 4 gemma serveurs Porc, Poule, Lapin et Ruminant sont passés en Release N
Problème sur la création de Gel à la main avec Fluo : bug sur la couleur des fluo en numérique résolu (normalement).
A vous de jouer.